High strain diversity among isoniazid-resistant M tuberculosis isolates from the Free State and Northern Cape provinces
Loading...
Date
2005
Authors
Mokhethi, Zac
Van der Spoel-Van Dijk, Anneke
Van der Zanden, Adri
Rigouts, Leen
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
University of the Free State
Abstract
English: This study set out to determine the diversity of the isoniazid-resistant M tuberculosis isolates causing pulmonary tuberculosis in the Free State and Northern Cape provinces of South Africa. Thirty-seven isoniazid-resistant isolates from a nation-wide survey could be fingerprinted by IS6110-based RFLP. Spoligotyping and MIRU-VNTR typing were performed to confirm inconclusive results. The number of IS6110 copies per isolate varied from 2 to 18, with nine (24.3%) isolates harbouring five insertions or fewer. Nine (24.3%) of 37 cases grouped into four RFLP-clusters. The clustered isolates with fewer than five IS6110 copies were all shown to be different when subjected to spoligotyping and MIRU-VNTR typing, whereas the clustering of the high-copy isolates was confirmed. The high degree of diversity among H-resistant isolates in the Free State suggests a low recent transmission rate, but this should be investigated by long-term analyses. For the Northern Cape province, representative sampling is needed before proper conclusions can be drawn.
Dutch: Het objectief is het bepaling van de diversiteit bij isoniazide-resistente M tuberculosis iso- laten die pulmonaire tuberculose veroorzaken in de Vrijstaat en Noordkaap provincies in Zuid Afrika. Zevenendertig isoniazide-resistente isolaten van een nationale survey konden worden getypeerd met IS6110-RFLP. Spoligotypering en MIRU-VNTR typering werden gebruikt als bijkomende subtypering. Het aantal IS6110 copiën per isolaat varieerde tussen 2 en 18, en negen (24.3%) isolaten bevatten vijf of minder inserties. Negen (24.3%) van de 37 gevallen groepeerden in vier RFLP-clusters. De isolaten uit de clusters met minder dan vijf IS6110 inserties werden gedifferentieerd met spoligo-typing en MIRU-VNTR typering, terwijl de hoge-copie clusters werden bevestigd. De hoge mate van diversiteit bij de H-resistente isolaten van de Vrijstaat zou een lage recent transmissie kunnen suggereren, maar moet bevestigd worden met lange-termijn analyses. Voor de Noordkaap provincie, is een representative staalname nodig vooraleer conclusies kunnen getrokken worden.
Dutch: Het objectief is het bepaling van de diversiteit bij isoniazide-resistente M tuberculosis iso- laten die pulmonaire tuberculose veroorzaken in de Vrijstaat en Noordkaap provincies in Zuid Afrika. Zevenendertig isoniazide-resistente isolaten van een nationale survey konden worden getypeerd met IS6110-RFLP. Spoligotypering en MIRU-VNTR typering werden gebruikt als bijkomende subtypering. Het aantal IS6110 copiën per isolaat varieerde tussen 2 en 18, en negen (24.3%) isolaten bevatten vijf of minder inserties. Negen (24.3%) van de 37 gevallen groepeerden in vier RFLP-clusters. De isolaten uit de clusters met minder dan vijf IS6110 inserties werden gedifferentieerd met spoligo-typing en MIRU-VNTR typering, terwijl de hoge-copie clusters werden bevestigd. De hoge mate van diversiteit bij de H-resistente isolaten van de Vrijstaat zou een lage recent transmissie kunnen suggereren, maar moet bevestigd worden met lange-termijn analyses. Voor de Noordkaap provincie, is een representative staalname nodig vooraleer conclusies kunnen getrokken worden.
Description
Keywords
Tuberculosis, South Africa, Free State, Northern Cape, Isoniazid-resistant isolates
Citation
Mokhethi, Z., Van der Spoel-van Dijk, A., Van der Zanden, A., & Rigouts, L. (2005). High strain diversity among isoniazid-resistant M tuberculosis isolates from the Free State and Northern Cape provinces. Acta Academica, (Supplement 1), 110-127.